История музея началась еще в царские времена – с коллекции, созданной при местной церковной школе учителем-краеведом Виктором Баженовым. Часть этих фондов – предметы быта, старинная одежда, школьные принадлежности царских времен – была сохранена и перешла в открытый в октябре 1966 года Вилегодский краеведческий музей.
Сейчас учреждение располагается в двух исторических зданиях конца XIX века. Внутри него — уникальные экспозиции, посвященные льноводству и ткачеству, также в музее представлен традиционный вилегодский костюм.
Юбилейной дате сотрудники музея посвятили новую экспозицию. В ней собраны уникальные документы, редкие фотографии и экспонаты, которые передавали учреждению первые дарители.